A principal diferença entre fruto agregado e fruto múltiplo é que o fruto agregado é um fruto resultante do gineceu apocárpico de uma única flor, enquanto o fruto múltiplo é um fruto resultante da ginecia de várias flores de uma inflorescência.
A flor é a estrutura reprodutiva das plantas com flores. Facilita a reprodução sexual. Existem diferentes partes de uma flor. Após a fertilização, os ovários amadurecem em frutos. Os óvulos fertilizados tornam-se sementes. Portanto, os frutos se originam das flores. Existem diferentes tipos de frutas. Frutas agregadas e frutas múltiplas são dois tipos entre eles; são frutas com vários ovários. O fruto agregado se origina de uma única flor que tinha vários pistilos livres. Em contraste, vários frutos se originam de inflorescências que possuem muitas flores individuais.