A principal diferença entre o ciclo do carbono e o ciclo do fósforo é que o ciclo do carbono é o ciclo biogeoquímico que descreve o movimento do carbono através da litosfera, hidrosfera, biosfera e atmosfera. Enquanto isso, o ciclo do fósforo descreve o movimento do fósforo através da litosfera, hidrosfera e biosfera.
Carbono, nitrogênio e fósforo são os três principais elementos importantes para todos os seres vivos. A circulação desses elementos por meio de componentes bióticos e abióticos presentes nos ecossistemas ou ambiente é descrita por seus ciclos biogeoquímicos. O ciclo do carbono explica a circulação dos elementos do carbono no ar, solo e água, enquanto o ciclo do fósforo explica o comportamento do fósforo no solo e nos organismos vivos. Uma das diferenças importantes entre o ciclo do carbono e o ciclo do fósforo é que o carbono se move principalmente pela atmosfera, enquanto o fósforo não interage com a atmosfera.