A principal diferença entre Azotobacter e Azospirillum é que Azotobacter é um gênero de bactérias que são principalmente diazotróficas aeróbias e endofíticas. Enquanto isso, Azospirillum é um gênero de bactérias promotoras de crescimento de plantas que são microaerofílicas e bactérias colonizadoras de superfície.
Azotobacter e Azospirillum são dois gêneros de bactérias importantes como fixadores de nitrogênio no solo. São principalmente bactérias do solo gram-negativas. Além disso, são bactérias de vida livre que se associam às raízes das plantas. Eles aumentam o crescimento e o desenvolvimento da planta após a inoculação. Azotobacter spp são bactérias heterotróficas e aeróbicas, ovais ou esféricas, enquanto Azospirillum spp são bactérias microaerofílicas e não fermentativas em forma de bastonete.