A principal diferença entre treponema borrelia e leptospira é que Treponema causa sífilis e Borrelia causa doença de Lyme e febre recorrente, enquanto Leptospira causa leptospirose.
As espiroquetas são grandes bactérias móveis em forma de espiral. Eles pertencem à ordem Spirochaetales. Existem duas famílias desta ordem: Spirochaetaceae e Leptospiraceae. Borrelia e Treponema são dois gêneros pertencentes à família spirochaetaceae. O gênero Leptospira pertence à família leptospiraceae. Todos os três gêneros, Treponema, Borrelia e Leptospira, são patogênicos para humanos.