A principal diferença entre brotamento e formação de esporos é que brotamento é um tipo de reprodução assexuada em que um novo organismo se origina de uma pequena estrutura semelhante a um botão desenvolvida no organismo parental, enquanto a formação de esporos é uma forma de reprodução assexuada em que novos indivíduos originam-se diretamente dos esporos do pai.
Brotamento e formação de esporos são dois métodos diferentes de reprodução assexuada. Ambos, o brotamento e a formação de esporos envolvem um único progenitor. Portanto, não há mistura ou troca de material genético. É por isso que os descendentes produzidos por brotamento e formação de esporos são geneticamente idênticos ao seu organismo original.