A principal diferença entre o polimorfismo transiente e balanceado é baseada em como os alelos se comportam. Polimorfismo transitório é a substituição progressiva de um alelo de um gene por outro alelo, enquanto o polimorfismo balanceado é a manutenção de dois alelos diferentes de um gene ao longo do tempo
O polimorfismo genético é uma ou duas ou mais variantes de um determinado DNA. Polimorfismo transitório e balanceado são dois tipos de polimorfismo que surgem devido a dois alelos alternativos de um gene. No polimorfismo transitório, dos dois alelos alternativos de um determinado locus, um alelo é progressivamente substituído por outro. No polimorfismo equilibrado, os dois alelos estão em equilíbrio um com o outro. Ambas as versões do gene são mantidas na população.
