A principal diferença entre hiperconjugação e conjugação de backbonding é a formação de ligações. Backbonding é o movimento de elétrons de um orbital atômico em um átomo para um orbital pi anti-ligação em um ligante, enquanto a hiperconjugação é a interação de ligações sigma com uma rede pi e a conjugação é a sobreposição de orbitais pi ao longo de uma ligação sigma.
Podemos discutir os termos backbonding, hiperconjugação e conjugação com referência às diferentes ligações químicas em compostos. Todos os três termos descrevem a sobreposição de orbitais de elétrons diferentes das principais ligações covalentes na molécula.