Diferença chave - VNTR vs STR
Os estudos de DNA têm imensa utilidade na compreensão e determinação de relações filogenéticas, no diagnóstico de doenças genéticas e no mapeamento de genomas de organismos. Diversas técnicas associadas à análise de DNA são usadas para a identificação de um determinado gene ou sequência de DNA em um pool de DNA desconhecido. Eles são conhecidos como marcadores genéticos. Os marcadores genéticos são usados em biologia molecular para identificar a variação genética entre indivíduos e espécies. Repetição tandem de número variável (VNTR) e repetição tandem curta (STR) são dois tipos de marcadores genéticos que mostram polimorfismo entre os indivíduos. Ambos os tipos são DNA repetitivo não codificador que são repetições em tandem. Eles são organizados em cromossomos da cabeça à cauda. VNTR é uma seção do genoma onde a sequência curta de nucleotídeos é repetida várias vezes. STR é outra seção do DNA dentro do genoma que é organizada como unidades repetidas consistindo de dois a treze nucleotídeos em cem vezes. A principal diferença entre VNTR e STR é o número de nucleotídeos em uma sequência repetitiva. As unidades de repetição de VNTR consistem em 10 a 100 de nucleotídeos, enquanto a unidade de repetição de STR consiste em 2 a 13 nucleotídeos. VNTR e STR são amplamente usados em estudos forenses.
CONTEÚDO
1. Visão geral e diferença principal
2. O que é VNTR
3. O que é STR
4. Semelhanças entre VNTR e STR
5. Comparação lado a lado - VNTR vs STR na forma tabular
6. Resumo
O que é VNTR?
Uma repetição em tandem é uma sequência curta de DNA que é repetida de cabeça a cauda em um locus cromossômico específico. Não há nenhuma outra sequência ou nucleotídeo dentro da repetição em tandem. Existem vários tipos de repetições em tandem no genoma. O VNTR é um tipo de repetição em tandem entre eles que tem unidades de repetição que consistem de 10 a 100 nucleotídeos. VNTR é um tipo de minissatélite. Essas repetições tandem podem ser encontradas em muitos cromossomos. Eles estão intercalados no genoma humano e estão situados predominantemente nas regiões subteloméricas dos cromossomos.
Os VNTRs mostram polimorfismo de repetição em tandem entre os indivíduos. O comprimento do VNTR em uma localização particular do cromossomo é altamente variável entre os indivíduos, devido à variação no número de unidades repetidas organizadas naquela seção de DNA. Portanto, o VNTR pode ser usado como uma ferramenta poderosa na identificação de indivíduos e a análise de VNTR é utilizada em muitos campos, incluindo genética, pesquisa em biologia, ciência forense e impressão digital de DNA. Os VNTRs foram os primeiros marcadores genéticos usados para quantificar o enxerto de transplante de medula óssea. Os VNTRs também foram os primeiros marcadores polimórficos usados em perfis de DNA em perícia.
Figura 01: Variação de VNTRs em seis indivíduos
A análise de VNTR é realizada através do polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição seguido por hibridização Southern. Portanto, ele precisa comparativamente de uma grande amostra de DNA. A interpretação do perfil VNTR também é problemática. Devido a essas limitações, o uso de VNTR em genética forense foi limitado e foi substituído pela análise de STR.
O que é STR?
STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas em tandem. STR é semelhante ao VNTR. Mas varia de VNTR do número de nucleotídeos em uma seqüência de repetição e o número de repetições. STR é um tipo de microssatélite.
A análise de STR envolveu a medição do número exato de unidades repetidas. Os STRs são altamente variáveis entre os indivíduos, semelhantes aos VNTs. Os perfis STR variam de pessoa para pessoa. Portanto, a análise de STR é usada em biologia molecular para comparar loci específicos no DNA de duas ou mais amostras. Portanto, os STRs são considerados marcadores genéticos poderosos em biologia molecular. Ele fornece uma excelente ferramenta para identificação de indivíduos devido ao seu alto grau de polimorfismo e comprimento relativamente curto.
Atualmente, os STRs são a ferramenta de polimorfismo genético analisada mais comumente usada em genética forense. A maioria dos casos forenses envolvem análise polimórfica STR. Os loci STR estão espalhados por todo o genoma. Existem milhares de STRs localizados em cromossomos que podem ser usados em análises forenses. A análise de STR não envolve polimorfismo de comprimento de restrição como a análise de VNTR. A análise de STR não corta o DNA com enzimas de restrição. Sondas específicas são usadas para anexar regiões desejadas no DNA e usando a técnica de PCR, os comprimentos do STR são determinados.
Figura 02: variação de STR entre amostras
Quais são as semelhanças entre VNTR e STR?
- VNTR e STR são DNA não codificantes.
- Ambos são repetições em tandem.
- Ambos apresentam polimorfismo entre os indivíduos devido à diferença no comprimento da seção do DNA.
- Ambos são usados como marcadores genéticos poderosos em impressões digitais de DNA e em estudos forenses.
Qual é a diferença entre VNTR e STR?
Artigo Diff meio antes da tabela
VNTR vs STR |
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| O VNTR é um DNA repetitivo não codificador que possui uma sequência de nucleotídeos curta repetida em tandem. | STR é uma seção de DNA altamente repetitiva que consiste em duas a treze unidades de repetição de nucleotídeos organizadas em tandem. |
| Tamanho | |
| VNTRs são maiores do que STRs. | STRs são menores do que VNTRs. |
| Número de Nucleotídeos em Sequência de Repetição | |
| A unidade de repetição do VNTR consiste de 10 a 100 nucleotídeos. | A unidade de repetição de STR consiste de 2 a 13 nucleotídeos. |
Resumo - VNTR vs STR
VNTR e STR são dois marcadores genéticos poderosos usados em biologia molecular, especialmente no campo da genética forense. VNTR é um tipo de minissatélite e STR é um microssatélite. VNTR e STR são DNA não codificantes e altamente repetitivos. Eles são repetições em tandem. A estrutura geral de VNTR e STR são as mesmas. No entanto, o número de nucleotídeos na sequência de repetição e o comprimento são diferentes. O VNTR tem sequências repetidas que consistem em 10 a 100 nucleotídeos. STR tem sequências repetidas consistindo de 2 a 13 nucleotídeos. Esta é a diferença entre VNTR e STR.
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