Diferença chave - Proteômica vs Transcriptômica
A tecnologia ômica é uma tendência atual, onde as diferentes biomoléculas de um organismo são vistas como um todo no que diz respeito às suas propriedades e funções. A tecnologia omic possui uma ampla gama de aplicações. As diferentes ômicas de uma amostra biológica incluem genômica, proteômica, transcriptômica e metabolômica. Proteômica envolve o estudo completo de todas as proteínas em um organismo vivo. É definido como o conjunto de todas as proteínas expressas em um organismo, suas propriedades estruturais e funcionais. O conjunto completo de proteínas, portanto, forma o proteoma. A transcriptômica é o estudo completo de todas as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) presentes em um organismo vivo. Assim, a transcriptômica lida com os genes que são ativamente expressos em um organismo vivo. O conjunto total de mRNA em um organismo vivo é denominado transcriptoma. A principal diferença entre Proteômica e Transcriptômica é baseada no tipo de biomolécula. Na proteômica, o conjunto total de proteínas expressas em um organismo vivo é estudado enquanto, na transcriptômica, o mRNA total de um organismo vivo é estudado.
CONTEÚDO
1. Visão geral e diferença fundamental
2. O que é proteômica
3. O que é transcriptômica
4. Semelhanças entre proteômica e transcriptômica
5. Comparação lado a lado - Proteômica vs transcriptômica na forma tabular
6. Resumo
O que é Proteômica?
O termo proteômica foi cunhado no ano de 1995 e foi inicialmente definido como o complemento protéico total em uma célula, tecido ou organismo. Com o avanço nos estudos proteômicos, ele foi modificado para ser considerado um termo abrangente no qual muitos campos de estudo foram incluídos. Atualmente, sob o tema proteômica, estudam-se a estrutura, orientação, funções, suas interações, suas modificações, suas aplicações e a importância das proteínas. Portanto, muitas pesquisas são conduzidas no campo da proteômica atualmente.
Os primeiros estudos proteômicos foram realizados para identificar o conteúdo protéico em Escherichia coli. O mapeamento do teor de proteína total foi feito em géis bidimensionais (2D). Após o sucesso disso, os cientistas passaram a caracterizar o conteúdo total de proteínas em animais como cobaias e camundongos. Atualmente, o mapeamento de proteínas humanas é feito usando eletroforese em gel 2D.
Aplicações da Proteômica
Existem muitas vantagens em estudar proteômica, pois as proteínas são as moléculas governantes da maior parte da atividade devido à propriedade catalisadora das proteínas. Assim, o estudo de proteínas inteiras pode fornecer informações sobre o estado de saúde de um organismo. Alguns aplicativos são;
- Anotação do genoma: ao estudar o conteúdo de proteína de um organismo, os genomas exatos responsáveis pelo composto ativo da proteína podem ser determinados. Neste cenário, os resultados de toda a genômica, transcriptômica e proteômica são importantes.
- Identificação / diagnóstico de doenças: a proteômica é usada na identificação da condição da doença, comparando o saudável e o doente
- Para realizar a expressão da proteína estudada durante a experimentação.
- Modificações de proteínas e estudos de interação: Para utilizar proteínas em condições in vitro ou e em condições in vivo, para decidir as condições de armazenamento dessas proteínas extraídas e para estudar o comportamento da proteína em métodos in vitro, in vivo e in silico.
Figura 01: Proteômica
Existem diferentes técnicas envolvidas na proteômica
- Extração da proteína total e separação das proteínas por eletroforese em gel 2D. As proteínas também podem ser separadas usando Cromatografia Líquida de Alto Desempenho (HPLC).
- Sequenciamento das proteínas extraídas usando métodos como o método de sequenciamento de Edmund ou espectrometria de massa.
- Uma vez que as sequências são identificadas, as propriedades estruturais e funcionais do conteúdo de proteína são analisadas usando software baseado em computador e ferramentas de bioinformática.
O que é transcriptômica?
O termo transcriptoma foi cunhado recentemente. A Transcriptômica é o estudo do conteúdo total de mRNA de um organismo. O mRNA total é o DNA expresso em um organismo vivo ou uma célula. A coleção completa de mRNA é conhecida como transcriptoma.
As etapas para analisar o transcriptoma incluem,
- Extração de RNA, separação de mRNA usando cromatografia em gel de coluna com esferas poli DT.
- O sequenciamento do mRNA é feito.
A tecnologia de microarray é uma forma comum de identificar o transcriptoma de um organismo. A técnica de microarray envolve uma placa de sonda com as fitas complementares do transcriptoma. Após a hibridização, o mRNA presente no organismo ou células pode ser caracterizado.
Figura 02: Técnicas transcriptômicas
A transcriptômica agora é amplamente usada na área médica. O diagnóstico de doenças e o perfil de doenças são os principais campos nos quais a Transcriptômica é usada. Ao analisar o transcriptoma de um organismo, o mRNA estranho pode ser identificado e, se houver infecções, ele pode ser identificado. O RNA não codificante pode ser separado por meio de tecnologias transcriptômicas. E também a expressão de genes sob diferentes estresses ambientais pode ser monitorada.
Quais são as semelhanças entre proteômica e transcriptômica?
- Ambos fazem parte do conceito de tecnologia ômica.
- Ambos são usados no diagnóstico de doenças e na caracterização de um organismo.
- Ambas as áreas de estudo envolveram a extração da biomolécula, separação da biomolécula e etapas de sequenciamento.
Qual é a diferença entre proteômica e transcriptômica?
Artigo Diff meio antes da tabela
Protêmica vs Transcriptômica |
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| Proteômica envolve o estudo completo de todas as proteínas em um organismo vivo. | A transcriptômica é o estudo completo de todas as moléculas de RNA mensageiro (mRNA) presentes em um organismo vivo. |
| Tipo de bio molécula estudada | |
| As proteínas são estudadas em proteômica. | mRNA são estudados em transcriptômica. |
| Fatores estudados | |
| Estrutura, função, interações, modificações e aplicações das proteínas são estudadas em proteômica. | Estrutura de sequência, interações com o ambiente e aplicações do mRNA são estudadas em transcriptômica. |
Resumo - Proteômica vs Transcriptômica
Omics desempenha um papel importante no campo das ciências da vida. Proteômica se refere ao estudo do proteoma que forma as coleções completas de proteínas em uma célula ou organismo. A transcriptômica se refere ao estudo do transcriptoma, que é o conjunto completo de DNA expresso que está na forma de mRNA. As duas áreas de estudo, proteômica e transcriptômica, foram derivadas após a introdução da genômica e atualmente são amplamente utilizadas em diagnósticos médicos e na caracterização e triagem de organismos. Esta é a diferença entre proteômica e transcriptômica.
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