A principal diferença entre o co-transporte e o contra-transporte é que o co-transporte é uma forma de transporte ativo secundário que transporta dois tipos de moléculas simultaneamente através da membrana plasmática na mesma direção ou direção oposta. Por outro lado, o contratransporte é uma das duas formas de cotransporte que transporta dois tipos de moléculas simultaneamente em direções opostas através da membrana celular.
As moléculas entram e saem através da membrana plasmática seletiva da célula. Existem vários tipos de proteínas transportadoras de membrana. O co-transporte e o contra-transporte são dois tipos de transporte ativo secundário. O co-transporte transporta dois tipos diferentes de moléculas ao mesmo tempo em um movimento acoplado, enquanto o contra-transporte ou troca é um tipo de co-transporte que transporta dois tipos de moléculas na direção oposta através da membrana.