A principal diferença entre oomicetos e zigomicetos é que os oomicetos não contêm quitina nas paredes celulares, em vez disso, contêm celulose, beta glucanos e aminoácido hidroxiprolina, enquanto os zigomicetos contêm quitosana nas paredes celulares. Outra diferença entre oomicetos e zigomicetos é que o estado vegetativo dos oomicetos é diplóide, enquanto os zigomicetos são haploides ou dicarióticos.
Oomicetos e zigomicetos são organismos eucarióticos microscópicos. Oomycetes se assemelha a fungos verdadeiros. Mas eles são moldes de água. Os zigomicetos são uma classe importante de filo Zygomycota, que são verdadeiros fungos. Eles são fungos ambientais ubíquos, saprofíticos.