A principal diferença entre micoplasma e clamídia é que micoplasma é um gênero de bactéria que não possui parede celular, enquanto a clamídia é um gênero de bactéria que inclui parasitas gram-negativos e obrigatórios.
As espécies de Mycoplasma são as menores bactérias já descobertas, com os menores genomas e um número mínimo de organelas altamente essenciais. Mycoplasma é uma bactéria sem parede. Portanto, eles não têm uma forma definida. Geralmente, são células esféricas a filamentosas. Em contraste, a clamídia é um gênero de bactéria que possui paredes celulares. Eles são bactérias gram-negativas. Tanto o micoplasma quanto a clamídia causam doenças sexualmente transmissíveis. Além disso, eles produzem sintomas semelhantes, mas podem ser tratados com antibióticos diferentes.