A principal diferença entre CRISPR e enzimas de restrição é que CRISPR é um mecanismo de defesa imune procariótica de ocorrência natural que foi recentemente usado para edição e modificação de genes eucarióticos, enquanto as enzimas de restrição são tesouras biológicas que clivam moléculas de DNA em substâncias menores.
A edição e a modificação do genoma são campos interessantes e inovadores da genética e da biologia molecular. Os estudos de terapia gênica usam amplamente a modificação genética. Além disso, a modificação do gene é útil para identificar as propriedades do gene, a funcionalidade do gene e como as mutações no gene podem afetar sua função. É importante derivar maneiras eficientes e confiáveis de fazer mudanças precisas e direcionadas no genoma das células vivas. CRISPR e enzimas de restrição desempenham papéis importantes nas modificações genéticas. CRISPR modifica genes com alta precisão. As enzimas de restrição funcionam como tesouras biológicas que dividem as moléculas de DNA em substâncias menores.