A principal diferença entre cariótipo e idiograma é que o cariótipo é a imagem real do total de cromossomos de uma célula, enquanto o idiograma é um diagrama esquemático de um cariótipo que ilustra todos os mapas cromossômicos.
Um conjunto de cromossomos representa o genoma e a informação genética de um organismo. Cada cromossomo tem uma forma, tamanho e um conjunto de genes exclusivos. O número e as estruturas físicas dos cromossomos revelam informações importantes sobre o organismo. Cariótipo é uma técnica realizada para examinar o conjunto completo de cromossomos em uma célula. Os cromossomos totais são coletados e analisados durante este teste para determinar se há anormalidades numéricas ou estruturais nos cromossomos. A imagem real que mostra os cromossomos totais de uma célula é o cariótipo, enquanto o diagrama esquemático dos cromossomos totais de uma célula é o idiograma. Ambos são importantes em estudos citogenéticos.
