A principal diferença entre o coeficiente de partição verdadeiro e aparente é que o coeficiente de partição verdadeiro é definido para um sistema sindicalizado, enquanto o coeficiente de partição aparente é definido para um sistema ionizado.
Os dois termos coeficiente de partição verdadeiro e aparente são usados principalmente na química farmacêutica, no que diz respeito à produção de medicamentos. No caso da ionização do fármaco, o coeficiente de partição verdadeiro dá a distribuição do fármaco em seu estado sindicalizado, enquanto o coeficiente de partição aparente dá a distribuição do fármaco em seu estado ionizado.