A principal diferença entre contig e cadafalso é que um contig não tem lacunas, enquanto um andaime consiste em contigs e lacunas.
O sequenciamento do genoma de organismos multicelulares é muito difícil em comparação com o sequenciamento de organismos unicelulares. O sequenciamento shotgun de genoma completo é uma técnica de sequenciamento de genoma fácil e rápida para genomas multicelulares. É um método que sequencia muitos fragmentos de DNA sobrepostos em paralelo. Nesse método, pequenos fragmentos são montados em fragmentos maiores e, em seguida, em contigs maiores usando um computador. Em seguida, os contigs são montados em suportes e, finalmente, em um cromossomo. Portanto, contig é um trecho contínuo de sequências de nucleotídeos, enquanto o arcabouço é uma porção do genoma que consiste em contigs e lacunas. Tanto o contig quanto o scaffold são sequências genômicas reconstruídas.
