Diferença chave - transposases bacterianas vs integrases retrovirais
O material genético transportável evoluiu com duas estratégias principais para se mover de uma região para a próxima região dentro e entre os genomas. Um método é deslocar através de uma molécula de RNA antes da formação de uma molécula de DNA, enquanto a outra via envolve intermediários de DNA. As transposases e as integrases virais são exemplos desse material genético transponível. As transposases bacterianas se ligam ao final dos transposons e facilitam a catálise do movimento do transposon para outra parte do genoma por meio de vários mecanismos. Integrases retrovirais são enzimas que auxiliam na integração do material genético de retrovírus, como o HIV, no material genético (DNA) da célula hospedeira que ele infecta. Esta é a principal diferença entre as transposases bacterianas e as integrases retrovirais.
CONTEÚDO
1. Visão geral e diferença principal
2. O que são transposases bacterianas
3. O que são integrases retrovirais
4. Semelhanças entre transposases bacterianas e integrases retrovirais
5. Comparação lado a lado - Transposases bacterianas vs integrases retrovirais em forma tabular
6. Resumo
O que são transposases bacterianas?
A transposase pode ser definida como uma enzima ligada ao final dos transposons que facilita a catálise do movimento do transposon para outra parte do genoma por meio de vários mecanismos. Esses mecanismos incluem 'mecanismo de recortar e colar' e 'mecanismo de transposição replicativa'. A transposase foi introduzida pela primeira vez por meio da clonagem da enzima necessária para a transposição do transposon Tn3. Duas estratégias importantes têm sido utilizadas pelos elementos genéticos transponíveis para o deslocamento entre genomas ou de um local para outro. O transporte por meio de um intermediário de RNA antes da síntese de uma cópia de DNA é uma estratégia, enquanto a outra está sendo ligada apenas a intermediários de DNA. As reações de recombinação que estão envolvidas na integração de ambos os elementos ocorrem devido a enzimas específicas do elemento. Portanto,em uma instância de elementos de DNA, essas enzimas são conhecidas como transposases, enquanto em uma instância de elementos de RNA, são conhecidas como integrases.
Ao comparar as diferenças entre as duas estratégias de transposição, o processo de inserção parece ser quimicamente idêntico. Porém, evidências recentes sugerem que certas semelhanças no mecanismo de integração são vistas nas regiões das sequências de aminoácidos que formam um sítio ativo; o motivo DDE. Atualmente, cinco famílias de transposases estão sendo classificadas, mas o número de famílias ainda não aumentou com os novos caracteres da transposase. As famílias incluem DDE transposase, Tirosina (Y) transposase, Serina (S) transposase, Rolling circle transposase, Reverse transcriptases / endonucleases (RT / En), etc. Estas famílias utilizam mecanismos catalíticos únicos para a quebra e reintegração do DNA. A transposase DDE envolve o mecanismo de cortar e colar do transposon original e carrega três conjuntos de aminoácidos conservados, a saber;aspartato (D), aspartato (D) e glutamato (E). As tirosinas transposases também envolvem o mecanismo de cortar e colar pela utilização de resíduo de tirosina, que é sítio específico.
Figura 01: Transposases bacterianas
As transposases de serina envolvem um intermediário de DNA circular e realizam o mecanismo de cortar e colar exatamente como as famílias acima. A transposase de círculo rolante envolve o mecanismo de cópia, onde uma única fita é copiada diretamente para o local alvo por meio da replicação do DNA. Isso garante que a fita modelo e a fita copiada tenham uma fita que foi recentemente sintetizada. A transcriptases reversa / endonucleases transposase possui vários mecanismos de transposição.
O que são integrases retrovirais?
No contexto da Integrase Retroviral, é considerada uma enzima retroviral que auxilia na integração do material genético de retrovírus como o HIV no material genético (DNA) da célula infectada. Essas integrases retrovirais costumam ser confundidas com fago integrases. Exemplos de fago integrases são λ fago integrase. Mas essas são enzimas completamente diferentes e não devem ser confundidas com elas. No que diz respeito à formação do complexo de pré-integração retroviral, a integrase retroviral desempenha um papel importante. As proteínas retrovirais integrase normalmente consistem em três (03) domínios canônicos. Esses domínios são conectados por linkers flexíveis.
Os três domínios incluem um domínio de ligação de zinco N terminal onde três feixes helicoidais são conectados e estabilizados através da coordenação com o envolvimento de um Zn 2+cátion, um domínio de núcleo catalítico RNase H e um domínio de ligação ao DNA C terminal, que é um SH3 vezes. Por investigação e por meio de informações bioquímicas e estruturais, sugere que a integrase retroviral tem a capacidade de funcionar como um dímero de dímeros (tetrâmero). No contexto de multimerização e ligação ao DNA viral, todos os três domínios da proteína retroviral integrase. A principal função da integrase retroviral é inserir seu material genético no DNA do hospedeiro. Esta etapa é a etapa mais crucial na replicação viral do vírus HIV. Depois de integrado com sucesso, ele permanecerá no DNA cromossômico da célula pelo resto de sua vida.
Figura 02: Integrases retrovirais
Portanto, uma vez integrado, não há retorno para a célula. Essas integrases retrovirais envolvem a catalisação de duas reações principais, incluindo processamento da extremidade 3 'e ligação covalente. Durante o processamento da extremidade 3 ', 2-3 nucleotídeos de ambas as extremidades 3' do DNA viral são removidos com a intenção de revelar os dinucleotídeos CA das extremidades 3 'do DNA viral, e durante a ligação covalente, as extremidades 3' processadas de DNA viral são ligados covalentemente no DNA cromossômico hospedeiro.
Qual é a semelhança entre transposases bacterianas e integrases retrovirais?
Tanto as transposases bacterianas quanto as integrases retrovirais têm sequências de aminoácidos semelhantes
Qual é a diferença entre transposases bacterianas e integrases retrovirais?
Artigo Diff meio antes da tabela
Transposases bacterianas vs integrases retrovirais |
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| A transposase bacteriana é uma enzima ligada ao final dos transposons enquanto facilita a catálise do movimento do transposon para outra parte do genoma por meio de vários mecanismos. | As integrases retrovirais são consideradas uma enzima retroviral que auxilia na integração do material genético de retrovírus como o HIV no material genético (DNA) da célula que está infectada. |
| Regiões de ligação | |
| São necessárias regiões de ligação específicas elevadas para as transposases bacterianas. | Menos ou nenhuma sequência de nucleotídeos necessária para a ligação. |
Resumo - Transposases bacterianas vs integrases retrovirais
As transposases bacterianas são consideradas uma enzima retroviral que auxilia na integração do material genético de retrovírus como o HIV no material genético (DNA) da célula que está infectada. Duas estratégias importantes têm sido utilizadas pelos elementos genéticos transponíveis para o deslocamento entre genomas ou de um local para outro. Atualmente, cinco famílias de transposases estão sendo classificadas, mas o número de famílias ainda não aumentou com os novos caracteres da transposase. Retroviral Integrase, é considerada uma enzima retroviral que auxilia na integração do material genético de retrovírus como o HIV no material genético (DNA) da célula que está infectada. As proteínas retrovirais integrase normalmente consistem em três (03) domínios canônicos. A principal função da integrase retroviral é inserir seu material genético no DNA do hospedeiro. Esta etapa é a etapa mais crucial na replicação viral do vírus HIV. Portanto, uma vez integrado, não há retorno para a célula. Esta é a diferença entre as transposases bacterianas e a integrase retroviral.
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