A principal diferença entre borazina e benzeno é que a borazina contém três átomos de boro e três átomos de nitrogênio na estrutura do anel, enquanto o benzeno contém seis átomos de carbono na estrutura do anel.
Tanto a borazina quanto o benzeno têm estruturas semelhantes com um anel de seis membros, e esses dois compostos são isoeletrônicos. Isso significa que tanto a borazina quanto o benzeno têm o mesmo número de elétrons ou a mesma estrutura eletrônica. No entanto, eles têm propriedades químicas e físicas completamente diferentes porque os anéis desses compostos consistem em átomos diferentes.