A principal diferença entre o genoma e o pool genético é que o genoma se refere a todo o DNA de um organismo, enquanto o pool genético se refere ao conjunto completo de genes únicos de uma população intercruzada.
Gene é a unidade estrutural básica da hereditariedade. Os genes passam de pais para filhos por meio de gametas. Além disso, eles estão presentes no genoma de um organismo. Genoma é o conjunto completo de DNA de um organismo. O pool genético também é um termo semelhante. Porém, representa a coleção de todos os genes presentes em uma população ou espécie. Em contraste com o genoma, o pool genético é uma mistura de genes de uma população. Consequentemente, o pool genético representa todos os alelos possíveis presentes nessa população específica.