A principal diferença entre a fecundação externa e interna é que a união dos gametas masculino e feminino na fertilização externa ocorre fora do corpo feminino, enquanto a união dos gametas masculino e feminino na fertilização interna ocorre dentro do corpo feminino.
A fecundação é o evento mais importante que ocorre na reprodução sexual. Em outras palavras, é o processo vital que cria uma prole de dois pais. Dois tipos de gametas; gameta masculino e gameta feminino unem-se durante a fertilização. Conseqüentemente, a fertilização pode ser vista apenas na reprodução sexuada. Os gametas são haploides e, quando se fundem, produzem uma célula diplóide chamada zigoto. Então, a mitose divide o zigoto e se desenvolve em um novo indivíduo. Aqui, existem dois tipos de fertilizações com base na forma como ocorrem. Eles são a fertilização externa e a fertilização interna. A fertilização externa, como o nome indica, ocorre fora do corpo feminino, enquanto a fertilização interna ocorre dentro do corpo feminino.