A principal diferença entre as células-tronco embrionárias e somáticas é que as células-tronco embrionárias são células indiferenciadas pluripotentes que têm origem embrionária, enquanto as células-tronco somáticas são células indiferenciadas multipotentes que são de origem em tecidos e órgãos.
As células-tronco são células indiferenciadas que são capazes de crescer em verdadeiros tecidos ou órgãos. Geralmente, existem dois tipos principais de células-tronco: células-tronco embrionárias e células-tronco adultas (células-tronco somáticas). No caso de diferenciação, as células-tronco embrionárias podem se diferenciar em qualquer tipo de célula. Em contraste, as células-tronco somáticas só podem se diferenciar em várias células específicas de tecido. Portanto, as células-tronco embrionárias são pluripotentes, enquanto as células-tronco somáticas são multipotentes. Em palavras simples, a capacidade de diferenciação é alta nas células-tronco embrionárias em comparação com as células-tronco somáticas.
