A principal diferença entre cisto e esporo é que o cisto é um estágio dormente de bactérias ou protozoários que facilita sua sobrevivência durante condições ambientais desfavoráveis, enquanto o esporo é uma estrutura reprodutiva que pode se desenvolver em um novo indivíduo.
Os microrganismos, especialmente as bactérias, produzem diferentes estruturas, como cistos, endosporos, etc. para sobreviver e se espalhar em diferentes ambientes. Os cistos são estruturas dormentes que os ajudam a sobreviver em condições ambientais adversas. Não é uma estrutura reprodutiva. Em contraste, um esporo é uma estrutura reprodutiva, que pode dar origem a um novo indivíduo. O objetivo deste artigo é discutir a diferença entre cisto e esporo.