A principal diferença entre pythium e phytophthora é que Pythium é um gênero de oomicetos que são principalmente patógenos de monocotiledôneas, enquanto Phytophthora é um gênero de oomicetos que são principalmente patógenos de dicotiledôneas.
Oomicetos são um grupo de organismos microscópicos eucarióticos aquáticos e terrestres que são filamentosos. Eles se assemelham a fungos. Além disso, semelhantes aos fungos, eles se reproduzem tanto sexualmente quanto assexuadamente. Oomicetos são freqüentemente patógenos de animais e plantas. Além disso, causam danos ambientais e econômicos significativos. Pythium e Phytophthora são dois oomicetos parasitas, portanto, patógenos. Ambos pertencem à ordem Peronosporales do filo Heterokontophyta.