A principal diferença entre a vacina de DNA e a vacina recombinante está na preparação das vacinas. A preparação da vacina de DNA ocorre usando genes ou fragmentos de DNA desejados, enquanto a preparação da vacina recombinante ocorre usando uma molécula recombinante ou um vetor contendo o fragmento do gene desejado.
As vacinações podem ser utilizadas como métodos de tratamento profilático, bem como como agentes terapêuticos contra infecções. Existem muitas formas de vacinação. DNA e vacinas recombinantes são as formas mais novas. Além disso, essas vacinas ainda estão em pesquisa.