A principal diferença entre o iniciador e o promotor é que o iniciador é uma sequência curta de DNA sintetizada comercialmente que é usada em PCR para amplificação de uma sequência de DNA alvo, enquanto o promotor é uma sequência de DNA específica que fornece um local de ligação inicial seguro para a RNA polimerase e fatores de transcrição em para iniciar a transcrição.
O iniciador e o promotor são dois tipos de sequências de DNA. Primer é um pequeno fragmento de DNA necessário para a reação em cadeia da polimerase (PCR). Possui sequências de nucleotídeos curtas complementares à extremidade flanqueadora da fita de DNA. Existem dois tipos de primers, que funcionam como pontos de partida para a síntese de novas fitas de DNA. Em contraste, um promotor é uma sequência de DNA específica localizada a montante do local de iniciação da transcrição de um gene. Ele interage diretamente com os componentes do mecanismo de transcrição, como a RNA polimerase e fatores de transcrição, a fim de controlar a transcrição do DNA. Portanto, a RNA polimerase e outros fatores de transcrição se ligam à sequência do promotor e iniciam a transcrição.
