A principal diferença entre o quadrado de Punnett e o pedigree é que o quadrado de Punnett exibe todos os genótipos possíveis que podem ser herdados de dois genótipos parentais, enquanto o pedigree representa a história familiar de uma característica particular, especialmente a herança de um gene.
O quadrado de Punnett e o pedigree são dois tipos de ferramentas que ajudam a determinar a probabilidade de herança de genes. Ambos mostram a probabilidade de herdar uma característica específica para a prole. Em outras palavras, ambos predizem padrões de herança em linhagens familiares. Portanto, eles podem ajudar a determinar o risco de uma doença hereditária em uma criança. O quadrado de Punnett é simplesmente uma forma gráfica de mostrar todos os genótipos possíveis que podem ocorrer em filhos de ambos os pais.