A principal diferença entre NMR e cristalografia de raios-X é que NMR é uma técnica analítica usada para determinar o tipo e o número de átomos em uma molécula orgânica, enquanto a cristalografia de raios-X é uma técnica analítica usada para determinar a estrutura atômica e molecular de um cristal.
O termo NMR significa ressonância magnética nuclear. Este termo vem sob o subtópico espectroscopia em química analítica. A cristalografia de raios X, por outro lado, é um tipo de técnica cristalográfica em que usamos um feixe de raios X para a análise de cristais.