A principal diferença entre os fagos virulentos e temperados é que os fagos virulentos matam as bactérias durante cada ciclo de infecção, uma vez que se replicam apenas por meio do ciclo lítico, enquanto os fagos temperados não matam as bactérias imediatamente após a infecção, pois se replicam usando os ciclos líticos e lisogênicos.
Fagos ou bacteriófagos são vírus que infectam bactérias. Os vírus se reproduzem por meio de dois mecanismos: ciclo lítico e ciclo lisogênico. Existem dois tipos principais de fagos baseados nos mecanismos de infecção e morte da bactéria hospedeira: fagos virulentos e fagos temperados. Os fagos virulentos se replicam por meio do ciclo lítico. Os fagos temperados se replicam por meio de ciclos líticos e lisogênicos. Os fagos virulentos mostram transdução generalizada e são capazes de matar a bactéria hospedeira após cada ciclo de infecção. Os vírus temperados mostram transdução especializada e não matam a bactéria hospedeira imediatamente após a infecção. Eles são capazes de integrar o DNA viral no cromossomo bacteriano e permanecer no estágio de profago por várias gerações bacterianas sem matar a bactéria.