A principal diferença entre a maltose e a isomaltose é que a maltose tem duas unidades de glicose unidas entre si por meio de uma ligação alfa 1-4, enquanto a isomaltose tem duas unidades de glicose unidas entre si por meio de uma ligação alfa 1-6.
A maltose é um dissacarídeo. Isso significa que tem duas unidades de açúcar unidas entre si. No caso da maltose e da isomaltose, a unidade de açúcar é uma molécula de glicose. Portanto, essas duas formas de dissacarídeos diferem entre si de acordo com a ligação química entre as duas unidades de glicose. No entanto, ambas as formas de açúcar reduzem os açúcares.