A principal diferença entre a fisiopatologia e a patogênese é que a fisiopatologia explica as condições tipicamente observadas durante um estado de doença, bem como os processos ou mecanismos que operam dentro de um organismo, enquanto a patogênese explica a origem e o desenvolvimento de uma doença e se a doença é aguda, crônica ou recorrente.
Fisiopatologia e patogênese são dois termos semelhantes usados para explicar a ocorrência de uma doença e mecanismos e características relacionadas. A fisiopatologia diz respeito às condições observadas durante um estado de doença e aos processos que ocorrem dentro de um organismo. A patogênese se concentra principalmente na origem e no desenvolvimento de uma doença. Ambos os estudos são importantes para diagnosticar uma doença e prevenir a propagação dela.
