A principal diferença entre Pseudomonas aeruginosa e Pseudomonas fluorescens é que a P. aeruginosa é um patógeno humano oportunista, enquanto a P. fluorescens não é um patógeno humano. Dizendo mais explicitamente, P. aeruginosa é um patógeno de plantas e animais, incluindo humanos, enquanto que P. fluorescence é uma espécie bacteriana que promove o crescimento de plantas. Outra diferença importante entre Pseudomonas aeruginosa e Pseudomonas fluorescens é que a P. aeruginosa tem a capacidade de crescer mesmo a 42 ° C.
Pseudomonas é um gênero bacteriano que compreende bactérias gram-negativas, em forma de bastonete e flageladas polares. São bactérias aeróbias que não formam esporos, são positivas para catalase e positivas para oxidase. Além disso, este gênero possui muitas espécies, incluindo P. aeruginosa, P. fluorescens, P. putida, P. Syringae, etc.