A principal diferença entre E. coli e Pseudomonas aeruginosa é que E. coli é uma espécie bacteriana anaeróbia facultativa que pertence à família Enterobacteriaceae e gênero Escherichia, enquanto P. aeruginosa é uma espécie bacteriana aeróbia que pertence à família Pseudomonadadaceae e gênero Pseudomonas.
Tanto a E. coli quanto a Pseudomonas aeruginosa são bactérias gram-negativas, em forma de bastonete e móveis. Além disso, são bactérias encapsuladas. Mas, E. coli é uma espécie do gênero Escherichia enquanto P. aeruginosa é uma espécie do gênero Pseudomonas.
