A principal diferença entre endocitose e exocitose é que a endocitose traz substâncias para dentro da célula, enquanto a exocitose transporta substâncias para o exterior da célula.
Uma célula possui uma membrana celular que atua como uma barreira entre o interior da célula e o ambiente externo. Portanto, tendo tal membrana, as células precisam de algum tipo de mecanismo de transporte para se conectar com o ambiente externo. Por exemplo, as células precisam obter nutrientes e excretar resíduos da célula. Para tanto, as células possuem quatro mecanismos básicos de transporte: difusão, osmose, transporte ativo e transporte a granel. Difusão e osmose são processos passivos, enquanto o transporte ativo e o transporte em massa são processos ativos que consomem energia. Endocitose e exocitose são dois tipos de mecanismos de transporte em massa, que transportam partículas grandes através da membrana plasmática, seja da célula para o ambiente externo ou do ambiente externo para a célula. Ambos os mecanismos formam vesículas delimitadas por membrana como meio de transporte.
