A principal diferença entre endossimbiose e simbiose é que a endossimbiose é uma teoria que descreve como mitocôndrias e cloroplastos entraram nas células eucarióticas, enquanto a simbiose é uma interação de longo prazo existente entre duas espécies vivas diferentes.
Os organismos em um ecossistema interagem uns com os outros de maneiras diferentes. A simbiose é uma interação que existe entre duas espécies diferentes que vivem juntas. Algumas interações beneficiam ambas as partes, enquanto algumas interações permanecem neutras. No entanto, algumas outras interações são prejudiciais para uma parte, especialmente para o organismo hospedeiro, enquanto a outra parte recebe benefícios às custas do hospedeiro. Podemos ver todos esses tipos de interações em um ecossistema. No entanto, esses tipos de interação são vitais para a estabilidade de um ecossistema. A endossimbiose, por outro lado, é uma teoria que explica a origem da célula eucariótica a partir de uma célula procariótica.
