A principal diferença entre congênere e isômero é que o congênere se refere a compostos químicos com estruturas e propriedades semelhantes. Enquanto isso, isômero se refere a moléculas com a mesma fórmula química, mas estruturas diferentes.
Os termos congênere e isômero referem-se a grupos de compostos que são agrupados de acordo com suas semelhanças. O termo congênere pode ter diferentes definições, mas em química usamos principalmente a definição de que congêneres são compostos químicos com estruturas e propriedades semelhantes. Os isômeros, por outro lado, são compostos com estruturas diferentes, mas composição atômica semelhante; portanto, eles também têm propriedades diferentes.
