A principal diferença entre quimioorganotróficos e quimiolitotróficos é que quimioorganotróficos são organismos que obtêm elétrons de compostos orgânicos, enquanto quimiolitotróficos são organismos que obtêm elétrons de compostos inorgânicos.
Os organismos vivos podem ser agrupados em várias categorias em relação ao modo nutricional baseado na fonte de energia e carbono. Existem fontes de energia como a luz solar e compostos orgânicos. Da mesma forma, existem dois tipos de fontes de carbono como carbono inorgânico e carbono orgânico. As quatro categorias principais são fotoautotróficos, foto-heterotróficos, quimioautotróficos e quimio-heterotróficos. Além disso, com base na fonte primária de redução equivalente, existem duas categorias como organotróficos e litotróficos. Quimioorganotróficos e quimiolitotróficos são dois grupos que usam energia para quebrar compostos químicos. Mas, eles diferem uns dos outros com base no doador de elétrons. A fonte do doador de elétrons são compostos orgânicos nos quimioorganotróficos, enquanto a fonte do equivalente redutor é inorgânica nos quimiolitotróficos.
