A principal diferença entre amônia quaternária e amônia é que a molécula de amônia quaternária tem um átomo de nitrogênio central ligado a quatro grupos alquil, enquanto a molécula de amônia contém um centro de nitrogênio ligado a três átomos de hidrogênio.
O amônio quaternário é um cátion derivado de uma molécula normal de amônia. Aqui, os três átomos de hidrogênio da molécula de amônia são substituídos por grupos alquil semelhantes ou diferentes, e há um grupo alquil extra ligado ao átomo de nitrogênio por meio de seu par de elétrons solitário.
