A principal diferença entre histopatologia e citologia é que a histopatologia é o estudo de tecidos doentes usando um microscópio, enquanto a citologia é o estudo de células individuais do corpo.
As células são as unidades estruturais básicas da vida. Durante o diagnóstico de doenças na medicina, células e tecidos inteiros são examinados por patologistas. O estudo dos tecidos em relação à doença é conhecido como histopatologia. Em contraste, o estudo de um único tipo de célula é conhecido como citologia. Portanto, a histopatologia analisa os tecidos enquanto a citologia analisa as células individuais.