A principal diferença entre a digestão de proteínas no estômago e no intestino delgado é que a digestão das proteínas no estômago ocorre pela pepsina e ácido clorídrico, enquanto a digestão das proteínas no intestino delgado ocorre pela tripsina e quimiotripsina secretada pelo pâncreas.
Os alimentos que consumimos estão sujeitos à digestão química e mecânica no sistema digestivo. Assim que o alimento é digerido, os nutrientes são absorvidos pela corrente sanguínea através do intestino delgado. A digestão das proteínas ocorre em duas fases: no estômago e na primeira parte do intestino delgado (duodeno) por proteases. No estômago, a pepsina decompõe as proteínas em aminoácidos e oligopeptídeos. A digestão posterior de oligopeptídeos em aminoácidos, dipeptídeos e tripeptídeos ocorre no intestino delgado por meio de enzimas pancreáticas.
