A principal diferença entre o hipoclorito de cálcio e o hipoclorito de sódio é que o hipoclorito de cálcio contém dois ânions hipoclorito associados a um cátion de cálcio, enquanto o hipoclorito de sódio contém um ânion hipoclorito associado a um cátion sódio. Na aparência, o hipoclorito de cálcio é um pó branco a cinza, enquanto o hipoclorito de sódio é um sólido amarelo-esverdeado com um odor adocicado.
O hipoclorito de cálcio e de sódio são compostos iônicos que contêm um cátion metálico e um ânion derivado do cloro. O número de ânions por cátion desses compostos difere entre si de acordo com a valência do cátion metálico.