A principal diferença entre cromossomos homólogos e homeólogos é que os cromossomos homólogos são cromossomos com ancestralidade comum, enquanto os cromossomos homeólogos são cromossomos de natureza ambígua e parcialmente homólogos.
Cromossomos são os componentes estruturais que carregam a informação genética de um organismo. O material nuclear nos eucariotos é organizado para formar cromossomos, que são estruturas compactas de ácidos nucléicos e proteínas. Além disso, existem diferentes tipos de cromossomos com base na maneira como eles sofrem divisão celular. Cromossomos homólogos e homeólogos são dois tipos de cromossomos que desempenham um papel importante no campo da genética.