A principal diferença entre íntrons e exons é que os íntrons são sequências não codificantes de um gene, enquanto os exons são sequências codificantes. Conseqüentemente, os íntrons não aparecem em moléculas de mRNA maduras, enquanto os exons coletivamente formam a molécula de RNA final.
Íntrons e exons são termos freqüentemente usados no campo da biologia molecular, mas quando alguém começa a se familiarizar com esses termos, pode surgir confusão, pois ambos são sequências de nucleotídeos de genes.