A principal diferença entre o rizoma e o estolão é que o rizoma é o caule principal semelhante a uma raiz que cresce no subsolo, enquanto o estolão é um caule que brotou do caule existente que corre horizontalmente logo abaixo da superfície do solo para formar uma nova planta e se conectar com a planta-mãe.
Rizomas e estolões são estruturas especiais de plantas. Eles são cruciais na reprodução vegetativa. Ambas as partes também podem armazenar alimentos. Não só isso, ambos ajudam as plantas a sobreviver em condições ambientais adversas. Estruturalmente, eles são caules. O rizoma é o caule principal que fica no subsolo, enquanto o stolon é um caule que brota do caule principal que corre horizontalmente no solo.
