A principal diferença entre adaptação e aclimatação é que a adaptação é um processo gradual, de longo prazo e irreversível mostrado pelos organismos vivos a fim de se ajustar ao novo ambiente por um longo período de tempo, enquanto a aclimatação é o processo de adaptação rápido, reversível e temporário mostrado por organismos vivos para mudar o ambiente dentro de um curto período de tempo.
Os organismos vivos precisam de um habitat ou nicho favorável para florescer e sobreviver. No entanto, os ambientes mudam devido a vários fatores. Entre eles, desastres naturais e atividades antropogênicas são duas causas principais. Os organismos vivos enfrentam desafios ao sobreviver em ambientes em mudança. Adaptação e aclimatação são duas formas de ajustes apresentadas pelos organismos vivos. A adaptação é um importante processo evolutivo de longo prazo, enquanto a aclimatação é um processo temporário e rápido que não é evolucionário importante.