A principal diferença entre protômeros e capsômeros é que os protômeros são unidades estruturais de proteínas oligoméricas, enquanto os capsômeros são proteínas individuais compostas de protômeros, que são subunidades estruturais do capsídeo viral.
Um vírus é um parasita intracelular obrigatório, que é uma partícula infecciosa. O capsídeo é um dos dois principais componentes de uma partícula de vírus. É uma capa protéica que envolve e protege o genoma viral. Um capsídeo compreende protômeros, que são as unidades estruturais de proteínas oligoméricas. Capsômero é uma subunidade estrutural do capsídeo viral, e é uma agregação de vários protômeros como uma unidade. Assim, os protômeros se automontam para formar um capsômero e os capsômeros se automontam para formar um capsídeo.
